新的计算策略提高了药物设计师针对膜内蛋白的能力

新的计算策略提高了药物设计师瞄准细胞膜内蛋白的能力

美国斯克里普斯研究所的化学家们展示了新型定制蛋白质，这些蛋白质可以有效地到达细胞膜内的靶标。他们使用一种独特的基于计算机的方法设计了针对红细胞生成控制剂促红素（EPO）受体的膜跨越区域的新型蛋白质。这项研究还产生了一个用于简化灵活的蛋白质定制设计工作流程的通用计算过程。

这一方法现在被研究人员用来开发潜在的新的膜内靶向治疗方法，涉及广泛的疾病范围。

该研究的合作通讯作者之一Marco Mravic博士说：“这项工作为调节细胞膜内的靶标打开了许多新的可能性，包括治疗应用和理解整个细胞生物学中的信号传导机制。”

长期以来，命中细胞膜内的靶标一直是生物医学领域的重要目标。然而，细胞膜内靶标并不是普通的目标，由于细胞膜通常由两层紧密排列的脂类分子构成，使其成为药物设计者更加困难的靶标。这使得膜内空间对于药物设计师来说比细胞表面或内部的水性区域更难击中。

为了做到这一点，他们必须扩展计算方法的前沿，结合已知的蛋白质相互作用在膜内的“数据挖掘”与传统基于物理的蛋白质相互作用预测。

最终，Mravic和他的同事设计出了第一个以一种新方式结合EPO受体膜跨越部分的蛋白质--这种方式在自然界中从未见过。该团队展示了这些蛋白质非常明确而有效地阻断了受体的功能。

这些结果可能对寻求新的抑制EPO受体的研究人员最感兴趣，因为肿瘤细胞经常异常激活EPO受体以维持它们的生长和存活。但对于Mravic和他的同事来说，这项研究首先代表了一种针对细胞膜内靶标的新和更灵活的方法的原理证明。