科学家发布最新的尖峰排序软件Kilosort4

神经科学家们一直依赖Kilosort软件来解析大量神经元同时活动的数据，以理解大脑细胞和电路如何共同处理信息。现在，由HHMI的Janelia研究校园的研究人员发布了Kilosort4，这是受欢迎的波形分选软件的更新版本，具有改进的处理能力，需要更少的手动工作，并且比以前的版本更准确和易于使用。

Marius Pachitariu领导的团队表示，他们在过去八年中不断改进算法，使其更加独立，以便用户可以直接使用。Kilosort已成为许多神经科学家的不可或缺的工具，但如果Pachitariu没有决定尝试新事物，它也许永远不会被开发出来。

Pachitariu的博士学位是计算神经科学和机器学习，但他渴望从事更多真实世界应用的工作，并且在完成博士学位后几乎离开学术界去从事工业工作。然而，最终他选择在伦敦大学学院肯尼斯·哈里斯和马泰奥·卡兰迪尼联合实验室做博士后研究，从事更多实验性的神经科学研究。

在他的博士后第一年，Pachitariu开发了最初版本的Kilosort。这个比以前方法快50倍的软件允许研究人员处理Neuropixels探针产生的数百万数据点。八年后，这些探针和软件已成为全球神经科学实验室的标配，使研究人员能够识别和分类单个神经元的脉冲。

2017年，Pachitariu成为了Janelia的一个研究组长，他和他的团队致力于了解成千上万的神经元如何共同使动物思考、决策和行动。如今，Pachitariu花大部分时间进行实验和数据分析，但他仍然找到时间来改进Kilosort。研究人员表示，新发布的Kilosort4在其类别中表现最佳，优于其他算法，并且能正确识别即使是难以检测的神经元。

Pachitariu说，在Janelia比在其他机构更容易抽出时间来进行像Kilosort这样的项目工作，因为在其他地方他将不得不花时间撰写拨款申请和教课。

他还表示喜欢不断完善Kilosort，这使他能够运用博士期间所学到的核心技能。